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Encyclopédie des Souches Probiotiques

Fiches complètes : mécanismes d'action, indications cliniques, dosages et études peer-reviewed pour chaque souche.

Bifidobacterium

Souches bifidus les plus documentées cliniquement.

B. longum Fort niveau de preuve
Bifidobacterium longum BB536
Bifidobacterium longum subsp. longum

Indications principales

  • Diarrhée associée aux antibiotiques
  • Infections respiratoires pédiatriques
  • Eczéma atopique nourrisson

Mécanismes d'action

  • Augmentation des IgA sécrétoires
  • Amélioration du transit intestinal (réduction du temps de transit colique)
Plus de 300 publications scientifiques. Souche la plus étudiée de la famille Bifidobacterium. L'une des souches probiotiques les plus étudiées au monde (>300 publications). Stimule l'immunité innée et adaptative. Référence en pédiatrie et grossesse.
Dosage recommandé
1–10 × 10⁹ UFC/jour · 4–12 semaines
B. bifidum Fort niveau de preuve
Bifidobacterium bifidum MIMBb75
Bifidobacterium bifidum

Indications principales

  • Hyperperméabilité intestinale
  • SII avec diarrhée
  • Intolérances alimentaires

Mécanismes d'action

  • Adhérence exceptionnelle aux cellules épithéliales intestinales
  • Renforcement des jonctions serrées (claudine-3, occludine, ZO-1) via TLR2/TLR4
  • Réduction de la perméabilité intestinale (test lactulose/mannitol)
  • Normalisation des taux de zonuline sérique
Guglielmetti et al. (Aliment. Pharmacol. Ther., 2011) — RCT (n=122) : réduction significative de la perméabilité intestinale et amélioration des symptômes du SII après 4 semaines.
Souche de référence pour la restauration des jonctions serrées. Adhérence exceptionnelle à l'épithélium. Réduit la zonuline sérique et normalise la perméabilité intestinale.
Dosage recommandé
1 × 10⁹ UFC/jour · 4–8 semaines
B. infantis Fort niveau de preuve
Bifidobacterium longum subsp. infantis 35624
Bifidobacterium longum subsp. infantis

Indications principales

  • SII (syndrome de l'intestin irritable)
  • Polyarthrite rhumatoïde
  • Endométriose
  • Auto-immunité
  • Induction des lymphocytes T régulateurs (Treg) via IL-10 et TGF-β
  • Activation des cellules dendritiques tolérogènes
  • Réduction de l'inflammation systémique
O'Mahony et al. (Gastroenterology, 2005) — RCT multicentrique : normalisation du ratio IL-10/IL-12 et réduction des symptômes du SII.
Probiotique le mieux documenté pour l'induction des Treg. Active les cellules dendritiques tolérogènes produisant IL-10 et TGF-β. Réduit l'inflammation systémique.
Dosage recommandé
1 × 10⁸ UFC/jour · 4–8 semaines
B. breve Fort niveau de preuve
Bifidobacterium breve M-16V
Bifidobacterium breve

Indications principales

  • Prématurité (entérocolite nécrosante)
  • Allergies alimentaires pédiatriques
  • Autisme (axe intestin-cerveau)
  • Colonisation efficace de l'intestin du prématuré et du nourrisson
  • Production d'AGCC renforçant la barrière intestinale
  • Réduction de la translocation bactérienne
  • Maturation des cellules Th1, réduction du risque d'entérocolite nécrosante
Pärtty et al. (JAMA Pediatrics, 2015) — réduction du risque de troubles neurodéveloppementaux chez les nourrissons supplémentés.
Dosage recommandé
1–3 × 10⁹ UFC/jour · 4–12 semaines
B. infantis EVC001 Fort niveau de preuve
Bifidobacterium longum subsp. infantis EVC001
Bifidobacterium longum subsp. infantis

Indications principales

  • Nourrisson né par césarienne
  • Nourrisson non allaité
  • Prévention maladies atopiques
  • Prévention autisme (risque familial)
  • Dysbiose néonatale
  • Seule souche capable de métaboliser l'intégralité des HMO (oligosaccharides du lait humain)
  • Rétablissement de la dominance Bifidobacterium chez 95 % des nourrissons traités
  • Stimulation de la maturation immunitaire néonatale (↑ Treg, ↓ Th17)
Henrick et al. (Cell, 2021) — réduction des marqueurs inflammatoires néonataux et modulation immunitaire durable chez les nourrissons traités.
Souche de référence pour la restauration du microbiote néonatal. Seule souche capable de métaboliser l'intégralité des HMO. Rétablit la dominance Bifidobacterium chez 95 % des nourrissons.
Dosage recommandé
8 × 10⁹ UFC/jour · 21–28 jours
B. lactis Modéré-Fort
Bifidobacterium animalis subsp. lactis Bi-07
Bifidobacterium animalis subsp. lactis

Indications principales

  • Infections respiratoires hivernales (personnes âgées)
  • Immunodépression
  • Diarrhée associée aux antibiotiques
  • Stimulation de l'activité phagocytaire des macrophages et neutrophiles
  • Augmentation de l'activité cytotoxique des cellules NK
  • Stimulation des IgA sécrétoires
  • Accélération du transit intestinal (réduction du temps de transit colique de 26 %)
Waller et al. (J. Nutr., 2011) — RCT : réduction du temps de transit colique de 26 % chez des adultes constipés après 4 semaines.
Dosage recommandé
2–10 × 10⁹ UFC/jour · 4–8 semaines
B. longum R0175 Modéré-Fort
Bifidobacterium longum R0175
Bifidobacterium longum

Indications principales

  • Dépression légère à modérée
  • Anxiété associée au stress
  • Réduction du cortisol salivaire en réponse au stress (-17 %)
  • Normalisation de l'activité EEG dans les régions frontales
  • Amélioration de la mémoire visuospatiale
  • Modulation de la production de GABA et sérotonine
Allen et al. (Translational Psychiatry, 2016) — RCT sur 22 volontaires sains : réduction du cortisol salivaire (-17 %) et amélioration de la mémoire visuospatiale après 4 semaines.
Psychobiotique développé par APC Microbiome Institute (Cork). Réduit le cortisol et améliore les performances cognitives. Souche de référence en recherche stress-cerveau.
Dosage recommandé
3 × 10⁹ UFC/jour · 4–6 semaines
B. adolescentis Faible-Modéré
Bifidobacterium adolescentis ATCC 15703
Bifidobacterium adolescentis

Indications principales

  • Dysbiose avec déficit en producteurs de butyrate
  • Prévention cancer colorectal
  • Producteur majeur d'acétate (cross-feeding vers les producteurs de butyrate)
  • Métabolisme de l'amidon résistant, FOS et inuline
  • Synthèse de vitamines B9 et B12
  • Modulation de la réponse immunitaire intestinale via cellules dendritiques tolérogènes
Espèce dominante dans le microbiote adulte sain. Associée à la longévité et à la santé métabolique dans les études de cohorte.
Dosage recommandé
5–10 × 10⁹ UFC/jour · 4–8 semaines
B. dentium Faible-Modéré
Bifidobacterium dentium Bd1
Bifidobacterium dentium

Indications principales

  • SII avec hypersensibilité viscérale
  • Axe intestin-cerveau
  • Principale espèce de Bifidobacterium productrice de GABA dans l'intestin
  • Modulation de la signalisation nerveuse entérique via GABA
  • Influence sur l'activité cérébrale via le nerf vague
  • Réduction de l'hypersensibilité viscérale
Bhatt et al. (Cell Host Microbe, 2020) — identification de B. dentium comme principal producteur de GABA dans le microbiote intestinal humain.
Dosage recommandé
1–5 × 10⁹ UFC/jour · 4–8 semaines

Lactobacillus

Souches lactobacilles les plus documentées cliniquement.

L. rhamnosus Fort niveau de preuve
Lactobacillus rhamnosus GG (LGG)
Lactobacillus rhamnosus

Indications principales

  • Diarrhée aiguë de l'enfant
  • Eczéma atopique (prévention)
  • Infections respiratoires
  • Adhérence aux cellules épithéliales du côlon via mannose-binding lectines
  • Inhibition de l'adhésion d'E. coli entéropathogène
  • Augmentation de ZO-1 et occludine, réduction de la zonuline (-23 %)
  • Production de propionate et acétate (modulation glycémie postprandiale)
Dosage recommandé
1–10 × 10⁹ UFC/jour · 4–8 semaines
L. acidophilus Fort niveau de preuve
Lactobacillus acidophilus NCFM
Lactobacillus acidophilus

Indications principales

  • Hypercholestérolémie
  • Infections urinaires récidivantes
  • Intolérance au lactose
  • Activation des cellules dendritiques intestinales → stimulation IL-12 → réponse Th1
  • Production de bactériocine acidoline et acidophiline
  • Réduction du cholestérol LDL par déconjugaison des acides biliaires
Dosage recommandé
1–10 × 10⁹ UFC/jour · 4–12 semaines
L. reuteri Fort niveau de preuve
Lactobacillus reuteri DSM 17938
Limosilactobacillus reuteri

Indications principales

  • Coliques du nourrisson
  • Dépression et anxiété
  • Autisme (comportements sociaux)
  • Ostéoporose
  • Production de reutérine (3-hydroxypropionaldéhyde) — antimicrobien large spectre
  • Stimulation de la libération d'ocytocine via le nerf vague
  • Réduction de TNF-α et IL-6, augmentation d'IL-10
  • Inhibition de H. pylori (uréase et adhésion)
Sgritta et al. (Cell, 2019) — restauration des comportements sociaux via l'axe nerf vague-ocytocine. Réduction de 74 % du temps de pleurs dans les coliques du nourrisson.
Dosage recommandé
1–10 × 10⁸ UFC/jour · 4–12 semaines
L. plantarum Fort niveau de preuve
Lactobacillus plantarum 299v
Lactiplantibacillus plantarum

Indications principales

  • SII (toutes formes)
  • Hyperperméabilité intestinale
  • Dépression et anxiété
  • Résistance à l'acidité gastrique et aux sels biliaires
  • Production de bactériocines (substances antimicrobiennes)
  • Stimulation des IgA sécrétoires et renforcement des jonctions serrées
  • Activation des cellules NK intestinales
Dosage recommandé
10 × 10⁹ UFC/jour · 4–8 semaines
L. casei Fort niveau de preuve
Lactobacillus casei Shirota
Lacticaseibacillus casei

Indications principales

  • Prévention infections nosocomiales
  • Amélioration de la motilité intestinale
  • Amélioration qualité du lait maternel
  • Stimulation de l'activité des cellules NK
  • Amélioration de la motilité intestinale
  • Réduction du temps de transit colique
Dosage recommandé
6,5 × 10⁹ UFC/jour · 4–8 semaines
L. salivarius Modéré
Lactobacillus salivarius PS2
Ligilactobacillus salivarius

Indications principales

  • Mastite du post-partum
  • Prévention infections mammaires récidivantes
  • Isolée du lait maternel humain
  • Réduit la charge bactérienne pathogène (S. aureus, S. epidermidis)
  • Production de bactériocines actives contre les staphylocoques
Fernández et al. (Breastfeeding Medicine, 2014) — RCT (n=352) : réduction de 51 % des cas de mastite et diminution significative de S. aureus dans le lait maternel.
Dosage recommandé
3 × 10⁹ UFC/jour · 3–4 semaines
L. gasseri Modéré
Lactobacillus gasseri SBT2055
Lactobacillus gasseri

Indications principales

  • Syndrome métabolique
  • Obésité abdominale
  • NAFLD associée à l'obésité
  • Réduction de l'absorption intestinale des graisses alimentaires (inhibition lipase pancréatique)
  • Réduction de la taille des adipocytes viscéraux
  • Production de gassericine A et T (bactériocines anti-H. pylori)
Dosage recommandé
2 × 10⁸ UFC/jour · 12 semaines
L. johnsonii Modéré
Lactobacillus johnsonii La1 (NCC533)
Lactobacillus johnsonii

Indications principales

  • Ulcère gastroduodénal
  • Prévention rechutes post-éradication H. pylori
  • Inhibition de l'adhésion de H. pylori à la muqueuse gastrique (récepteurs Lewis b)
  • Stimulation des IgA sécrétoires gastriques
  • Réduction de l'IL-8 et TNF-α induits par H. pylori
Felley et al. (Aliment. Pharmacol. Ther., 2001) — RCT : L. johnsonii La1 réduit la densité de H. pylori dans la muqueuse gastrique et l'inflammation associée.
Dosage recommandé
10⁷–10⁸ UFC/jour · 4–8 semaines

Mécanismes d'action des probiotiques

Comment les souches probiotiques interagissent avec l'hôte.

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Renforcement de la barrière intestinale

Les probiotiques augmentent l'expression des protéines de jonction serrée (claudine, occludine, ZO-1), réduisent la perméabilité intestinale et normalisent la zonuline sérique.

Modulation immunitaire

Induction des lymphocytes T régulateurs (Treg), activation des cellules dendritiques tolérogènes, stimulation des IgA sécrétoires et équilibre Th1/Th2.

🧠

Axe intestin-cerveau

Via la production de GABA, sérotonine, dopamine et la stimulation du nerf vague, les probiotiques influencent le comportement, l'anxiété et les fonctions cognitives.

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Production d'AGCC

Acétate, propionate et butyrate produits par les bactéries coliques : énergie colonocytaire, réduction de l'inflammation, amélioration de la sensibilité à l'insuline.

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Compétition microbienne

Exclusion des pathogènes par compétition de sites d'adhésion, production de bactériocines et d'acide lactique, réduction du pH luminal.

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Métabolisme biliaire

Déconjugaison des acides biliaires par la BSH (bile salt hydrolase), réduction du cholestérol LDL et modulation de la vidange gastrique.